人从膳食中摄人的钙，微量元素检测仪分析一部分在小肠被吸收进入血液中，参与骨骼代谢等多种生理过程，代谢后经尿液、汗液及肠道分泌的消化液排出体外，而未被吸收的钙则直接从肠道排出。
可见，摄入的钙并不是都可以被机体吸收，钙的吸收率受很多因素的影响。全自动微量元素检测仪认为钙主要在小肠吸收，确切地说，是在小肠上半段。小肠吸收钙有两种机制：一种是小肠细胞主动吸收钙离子，把它转运至血中；另一种是当肠腔中钙离子浓度较高时，钙离子可以自动渗透过细胞膜进入到血液中。前一种机制需要消耗能量，后一种则不需要。一般肠道主动吸收在钙吸收中起主要作用，自动渗透吸收仅在钙离子浓度较高时起部分作用。但肠道中钙离子较多时，主动吸收作用可能饱和，而自动渗透作用则不会饱和。
肠道对钙的主动吸收需要依赖维生素D和钙结合蛋白的配合。维生素D在肾脏被活化成1.25-(OH)2-D3，活化后的维生素D能促进钙结合蛋白产生，钙结合蛋白在肠腔中与钙离子结合，将钙离子转运到小肠吸收细胞内，再由钙泵转运到血液中。
近来有人提出除以上两种吸收机制以外，还有另外一种吸收机制，就是分子补钙理论。这个理论认为，某些特殊的具有生物活性的钙鳌合物可以不依赖钙结合蛋白以较大的吸收率直接被吸收进入细胞中，这个过程类似于自动渗透作用，但普通的自动渗透作用的吸收率非常小，而“分子钙”的吸收率却大得多，这个理论尚需更多的实验证实。
钙进入人体后，99%以羟磷灰石的形式分布在骨骼和牙齿中，构成人体的支架，是机体钙的储存池；另外的1%分布在软组织和血液中，称为混溶钙池。在正常情况下，骨钙中有99%的钙是相对稳定的，属于稳定性钙，而另有1%是不稳定的，又称为可溶性钙，与软组织和血液中的钙共称为不稳定性钙。生理条件下，稳定性钙和混溶钙池中的钙通过可溶性钙不断进行成骨和破骨作用实现钙的交换，达到一种动态平衡。由于体液中的钙浓度必须保持恒定才能维持正常的生命过程，因此，当钙摄入不足、机体缺钙时，为维持体液中正常的钙浓度，机体势必要通过影响激素的分泌，使钙在体内进行再分布，此时破骨作用大于成骨作用，骨骼中的钙逐渐流向血液。若这种再分布过程长期进行，就可造成缺钙性疾息，一方面大量的骨钙溶出可造成骨质疏松症等，另一方面大量溶出的骨钙可经血液进入细胞内，使细胞内的钙离子浓度升高，这就可能引起高血压等疾病。
钙的排泄主要是通过尿液、粪便和汗液三种途径。一般钙摄入量多，排泄也就多，反之亦然。但钙的排泄还受到年龄、饮食等多种因素的影响。其中最主要的是参与钙代谢平衡调节的丰要有三种激素——甲状旁腺素、降钙素和雌激素。
钙的代谢就是在如此多的因素的调控下维持动态平衡的。由于激素的调节作用，在一般情况下，钙摄入量的变化不会对机体造成严重的影响。但长期摄钙过少，会使甲状旁腺素分泌增多。久而久之将造成甲状旁腺功能亢进，使血钙浓度偏高。这可给机体造成许多不利影响，造成骨质疏松、增生、高血压等。
